प्रतिरक्षी प्रतिजन का उपयोग प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा रोगजनक बैक्टीरिया और विषाणुओं की पहचान करने एवं उनकों नष्ट करने के लिए किया जाता है।